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锁核酸(LNA)合成
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锁核酸(Locked Nucleic Acid,LNA)是一种新型的双环状寡核苷酸衍生物,其中β-D-呋喃核糖的2'-O、4’-C位通过缩水作用形成刚性的缩合结构。由于LNA和核苷酸在结构上存在着高相似性,因此与DNA和RNA具有极强的结合亲和力。当与互补的DNA或者RNA链杂交时,LNA寡核苷酸表现出极强的热稳定性。对于每一个嵌入的LNA单体,其双链的Tm值增加2-8°C。此外,LNA寡核苷酸可比DNA或者RNA寡核苷酸合成的更短,但是它还能保持高的Tm值。这一优势使其被广泛用于检测很短的靶序列或者很相似的靶序列,可以被用于基因研究和疾病诊断。
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特点
- 杂交亲和力好:通过Watson-Crick碱基配对,比DNA-DNA、RNA-RNA杂交分子有更高的热稳定性。
- 反义活性好:环状结构使得杂交复合物的稳定性高,特定条件下可激活RNase H降解活性。
- 生化稳定性好:具有抗脱氧核苷酸酶降解的稳定性。
- 水溶性好:可以轻松穿过细胞膜,被细胞吸收。
用途
由于LNA寡核苷酸通常是由LNA与DNA或者RNA的混合物组成,这样可以通过改变寡核苷酸中LNA含量来优化其敏感度与特异性。将LNA嵌入到寡核苷酸已被证明可以显著改善许多基于杂交技术的灵敏度与特异性。目前,LNA寡核苷酸已成功的广泛应用于下列领域:
- miRNA研究
- 小RNA研究
- SNP基因分型
- mRNA反义寡核苷酸
- 等位基因特异性PCR
- RNAi
- DNAzymes
- 荧光偏振探针
- 分子信标
- 微阵列基因表达谱分析
- 基因修复与外显子跳跃
- 拼接变异检测
- 比较基因组杂交(CGH)
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