CRISPRclean技术
来自生物科技企业Jumpcode Genomics,消除核糖体噪音,将测序工作集中在高价值RNA上
利用CRISPR的特异性,使用CRISPRclean®完善NGS库
~66%
的人类基因组是重复DNA
~90%
的来源于单细胞数据集的读长(reads)是噪音
>90%
的来自于RNA-Seq的数据是大量的核糖体、线粒体或管家基因
从基因组和转录组中对数百万读长进行测序的能力在基因和遗传变异方面产生了前所未有的发现。不幸的是,这些读长被浪费在重复捕获的过多序列上。
通过消除过多序列的噪声,未来的发现可能会加快。为了实现这一发现,需要将注意力从大量的基因转移,并通过降低背景噪声来提高灵敏度。这就是我们创建CRISPRclean的原因。
CRISPRclean技术利用CRISPR-Cas9的特异性来降解下一代测序(NGS)库中大量的无信息序列。使用CRISPRclean,您可以看到更多表达量较低的转录本,并转移测序能力以实现更深的覆盖范围和更好的信号。
现在,你可以准确地看到你想要的东西,打破混乱,开拓新天地。
CRISPRclean技术的优势
高度可编程
提高灵敏度
自动化工作流
基因组分析平台
CRISPRclean的工作原理
CRISPRclean介导的去除可以根据应用在不同点直接集成到NGS文库制备protocol中。CRISPR-Cas9复合物与设计的引导RNA池形成。切割目标序列后,它们不能作为PCR扩增或后续测序的底物。输出是一个精炼的、序列就绪的NGS库。
应用
CRISPRclean技术是一种特殊且高度可编程的技术,可在许多应用中去除不需要的序列。
查看下面的应用,了解CRISPRclean是如何推动发现的。
单细胞分析
深入了解单个细胞的表达谱
微生物组
描述微生物种群及其对人类健康的影响
传染病监测
检测已知和新病原体,以加快疫情调查
全转录组分析
测量基因和转录物活性以研究基因表达模式
产品展示
CRISPRclean Plus Stranded Total RNA Prep with rRNA Depletion
(Human, Mouse, Rat, Pan Bacteria)
使用CRISPRclean Plus识别低表达转录本
CRISPRclean Stranded Total RNA Prep with rRNA Depletion
(Human, Mouse, Rat)
RNA序列的特异性、无偏rRNA去除和文库准备
关于 Jumpcode Genomics
Jumpcode Genomics是一家美国基因检测试剂生产商,提供CRISPRclean专利技术。该技术可为基础研究、传染病、肿瘤学和消费者基因组学领域的全球研究人员提供下一代测序。该过程适合标准的下一代测序工作流程,并可以与大多数市售的文库制备解决方案一起使用。
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